ISO/TS16949和ISO9001主要区别在于前者是汽车行业技术标准，和ISO9001有共同点，是质量管理体系，ISO/TS16949标准中包括了ISO9001所有条款，甚到现在新版本ISO9001：2008都包含在内。

 ISO9001是适用于各个行业，包括政府机关、学校等行政事业单位，而16949仅适用于汽车供应链上的所有企业。

TS16949是在ISO9001基础上针对汽车行业进一步提出的特殊的要求，相对于9001来说16949的要求更高。TS16949更加 重视激励员工与充分授权，给员工创造一个革新的环境，让员工快乐地工作，创造性地工作。TS16949 对于顾客的工程规范与工程标准，要求组织在两周内完成评审并发布，在时间上作出了强制规定。

TS16949比ISO9001条款要多一些，控制严格，都是以顾客为中心，但最明显的就是强调过程管理方法，并增加了产品质量先期策划控制程序和生产件批准程序。
对于小公司，这两项尤为麻烦。

一般ISO9001只要客户下单就可以生产交货，而TS16949体系不行，必须制作一份APQP（产品质量先期策划），先要据客户要求进行产品开发可行性分析，分析确实可行后，然后研发部进行样品制作，制作好后送客户确认，确认后还要根据原配方做小批量试产，等试产交客户也通过时，才能正式批量生产。而且以后这个配方的任何改动，包括管理人员调动或工艺更改或设备更换都要重新打样和试生产，经客户认可后批量生产。
两者之间最大的区别就在此啦。